Indemnités journalières

Bonjour je viens de recevoir un document qui me stipulé que mon accident de travail ne relevé pas de la sécurité sociale.
Je suis titulaire dans le milieu hospitalier public.
Je voulais savoir si en ayant envoyé mon document initial d'AT à mon employeur et que mon médecin ai prit mon document pour pouvoir se faire régler par la société d'assurance de notre hôpital si je devais faire d'autres démarches pour recevoir mes indemnités ou j'ai fais le nécessaire.
Je vous remercie