Déclaration d'inaptitude médecin conseil

Bonjour, je suis en maladie professionnelle depuis 18mois, je ne peux a ce jour reprendre mon poste de travail, et je souhaite me reconvertir. Après enquête de la sécu il apparaît évident et que mon travail est responsable de mon état. Le médecin du travail m'a donc déclaré inapte avec un taux d'IP sur mon poste de travail. Jusqu'ici la médecine du travail m'a baladé me disant un coup on vas vous mettre inapte et au rdv suivant, il y a trop d'handicapés dans cette région on vous mets pas inaptes, prolongeant ainsi la galère financière et l'impossibilité de me reconvertir sauf si j'abandonnais ma procédure et que je démissionner.
Ma question est la suivante, la médecine du travail doit elle suivre le médecin conseil ?
Si non, qu'elle sont les options ?
Merci,
Bonne journée