Accident de travail refusé par employeur mais finalement accepté par la cpam

Bonjour, je viens vers vous car comme indiqué dans le titre j'ai eu un accident de travail qui a été refusé par mon employeur et après investigation de la CPAM, celle-ci vient d'accepter la prise en charge.
Je n'ai pas trouvé de réponse sur le net quant à la suite de cette investigation:
j'ai été indemnisé en maladie "normale" durant mon arrêt (pendant l'investigation : remplissage questionnaire pro etc..) quelle sera la suite à donner?
vais-je recevoir un dernier paiement qui ajustera le montant entre maladie et accident ?
il est indiqué sur le site ameli que la prise en charge de l'accident commence au lendemain de celui-ci , le reste à charge du jour de l'accident revient à l'employeur.. mais sur ma fiche de paie je n'ai jamais été payé ? comment cela se passe t-il vu ma situation "complexe"? (j'ai du démissionner de mon emploi car mon employeur voulait me licencier a cause de mon accident.. "harcèlement..." bref.
qu'en sera t-il de la suite ?
En vous remerciant par avance..
bien cordialement