durée des IJ en ALD si mi-temps thérapeutique imposé par le médecin du travail ?

En ALD depuis le 16/01/2018 et en arrêt total de cette date jusqu'au 3/09/2018 puis reprise à mi-temps thérapeutique suite à visite de reprise à la médecine du travail. Si je suis les préconisations du médecin du travail c'est à dire je travaille à mi-temps, suis-je indemnisé ? Au 1er janvier 2019 je totalise 347 jrs d'indémnisation. Depuis septembre je travaille à mi-temps mais je suis indémnisé sur 31 jrs, est-ce normal ? En ALD est ce que c'est 360 jrs maximum d'indemnisation ou 3 années ? Et si IJ épuisées que dois je faire si impossibilité de reprise à temps plein ? J'ai fait une demande de pension d'invalidité mais pour l'instant elle n'a pas été accepté car mon état de santé n'est pas stabilisé.