Arrêt maladie dans un seul mi-temps

Bonjour, Je dispose de deux mi-temps (un contrat à 50% chez un employeur, et un contrat à 50% chez un autre). Je subis du harcèlement moral depuis plusieurs mois, mais la direction ne prend aucunes décisions. Nous avons lancé un droit d'alerte avec des collègues car je ne suis pas la seule dans ce cas là. J'ai vu la médecine du travail qui m'a conseillé de me mettre en arrêt au regard de ma détresse psychologique. Cependant, est-il possible de bénéficier d'un arrêt uniquement pour ce mi-temps où je subis du harcèlement? Et d'aller au travail dans mon autre mi-temps? Je ne me vois pas être en arrêt complet car je pense que je vais déprimer encore plus. Et mon angoisse ne vient qu'à l'arrivée de mes jours de présence dans le mi-temps où cela se passe très mal. Merci par avance pour votre réponse.