travail en début d'arrêt maladie

mon salarié a eu un arrêt de travail à compter du 3 août et a continué de travailler jusqu'au 5 août. il ne m'en a prévenu que le 5 août après midi étant en congé payé le soir même jusqu'à aujourd'hui le 20 août. c'est seulement aujourd'hui le 20 août qu'il m'informe qu'il ne reprendra pas le travail et me fait parvenir son arrêt de travail débutant le 3 août. j'ai transmis une DSN évènementielle avec dernier jour travaillé au 5 août tout en sachant que la cpam que j'ai contactée n'a pas encore son arrêt de travail dont la fin va jusqu'au 2 novembre. comment va t'il être indemnisé c'est pour savoir comment faire établir son salaire?
Merci pour votre réponse.