Arrêt maladie après une fin de mes droit

Bonjour, je suis en ALD depuis bientôt 5 ans, j'ai fini ma période de mes droit le 16 Janvier 2020 (reprise de seulement 11mois de travail), j'ai été donc mise en invalidité cat1 depuis cette date et le 21/08/2020 j'ai été licencié pour inaptitude.
Depuis je suis au chômage indemnisé, et je n'ai pas repris le travail, pour différentes raison de santé. Ma conseillère pôle emploi me dit qu'il faut que je me mette en arrêt vu que je ne peux pas travailler pour le moment. Ma question c'est que vu ma fin de droit comment vais je être indemnisé si je me met en arrêt ? Car un chômage indemnisé depuis 1 ans compte t'il comme une reprise éventuelle de travail ? Je suis perdu, et je ne trouve pas de réponse exacte sur les forum etc.
Merci à tous