Envoi arrêt maladie bug informatique

Bonjour, je viens de me rendre compte que mon précédent arrêt (prolongation) n'ai pas affiché sur mon compte ameli, je me suis donc renseigné auprès de mon médecin qui envoi lui même l'arrêt à la CPAM par informatique. Il m'a informé que il y a avais eu un bug informatique et que il ne s'était donc pas envoyé, il m'a sortie un duplicata que j'ai déposer directement à la CPAM.
Est ce que je vais pouvoir percevoir les indemnités journaliere? De cou mon arrêt actuel qui est donc une prolongation à été qualifié de initial sur ameli (du a l'absence du précédent arret).
Est ce que il vont pouvoir modifier et le mettre en prolongation?