Arrêt prolongation suivi d'un arrêt initial

Bonjour, je suis en arrêt depuis 3mois par mon PSY qui va me prolonger encore un peu jusqu'à mon opération prévue depuis quelques mois (rien à voir avec mon arrêt initial). l'opération va me redonner un arrêt initial +prolongation de 3 semaines. Est ce que cela va passer en initial et que les calculs de mes IJ vont rester à 100% au lieu des 75% (période après 90jours) ?
Est il préférable de laisser 1 ou 2jours entre afin que je sois payé à 100%?
Sur quelle base je serai payé, sur mes 3 dernières fiches de salaire ou 12 derniers mois ?
Paralellement à cela, je dois m'inscrire à Pole emploi car je suis licencié Eco, et le démarrage de mes paiements se ferons qu'à partir d'un mois ( oui on me règle mes congés pas pris). comment ça se passe pour le mois de carence et le règlement des IJ ??
merci à vous