passé d'accident de travail a arret maladie les consequences?

je suis en accident de travail depuis plu de deux mois maintenant
le médecin avait constaté une lombalgie et une sciatique entre temps j'ai passée un irm ils ont constaté une hernie discale
le médecin a changé l'intitulé de la constatation sur le certificat médical et deux jours après je reçoit une lettre de la sécurité sociale et disant que le médecin conseil ne trouve aucune relation n'a été établie entre cette demande et mon accident de travail .
donc j’ai contesté tjrs pas de nouvelle et mon médecin ma mis en arrêt maladie .
Je voudrait savoir les conséquences que je risque d'avoir avec se changement