Arrêt maladie et certificat d aptitude à assister en cours

Bonjour,
Je suis alternante et suis en arrêt maladie depuis un certain temps. Je me sentais capable de retourner en cours et j'ai donc demandé à mon médecin traitant un certificat attestant que je pouvais suivre les cours. Seulement je n ai pas pu me présenter à 2 cours me sentant mal.
Mon école me demande de justifier mes absences or je leur ai déjà fournis mon arrêt de travail. Leurs arguments étant que mon certificat attestant ma capacité à aller en cours supprime mon arrêt maladie.

Que puis-je faire pour justifier mes absences ?