Maladie professionnelle fonction publique territoriale

Bonjour je suis sur un régime spécial comme je suis fonctionnaire, j ai fait une demande de maladie professionnelle qui a été accepté et confirmer par le médecin du travail une commission indépendante qui n'est pas la sécurité sociale mais auparavant mon dossier était à la sécurité sociale ou la demande avait été fait par erreur et il m'a répondu négative non que ma maladie n'était pas professionnel donc je me trouve avec deux décisions est-ce que c'est la décision de la sécurité sociale qui prime ou la décision de la fonction publique avec le comité qui prime qui croire sachant que je suis fonctionnaire territorial titulaire et que je dépends du régime spécial qui n'est pas à la sécurité sociale normalement