Accident de travail (contractuel fonction publique en fin de CDD)

Bonjour,
Je suis contractuelle dans la fonction publique d’état depuis 2012.
En juillet 2016 j’ai été victime d’un accident de trajet.
J’ai eu une rupture des ligaments croisés antérieurs.
À la suite de cet accident j’ai dû subir une intervention chirurgicale en janvier 2017.
Mon accident a bien été reconnu comme accident de trajet par mon administration.
À la suite de ma consolidation j’ai été convoqué par le service médical de la caisse primaire d’assurance maladie.
Mon employeur a fait de même en m’envoyant consulter un expert médical spécialisé en chirurgie orthopédique.
Il y a quelques jours j’ai reçu une notification de la caisse primaire d’assurance maladie me précisant qu’un taux d’incapacité de 3% m’avait été attribué. Cependant, du faite d’autres accidents de travail il me proposer deux solutions :

• Soit une indemnité sous forme de capital
• Soit une rente optionnelle annuelle
De son côté mon employeur c’est-à-dire la fonction publique d’État me propose un taux d’incapacité de 5 % déterminé par leur médecin expert.
Il me propose une somme sous forme de capital versée en une seule fois.
Cependant, mon employeur a été avisé par la caisse primaire d’assurance maladie de leur souhait de me verser une indemnité.
Aussi, mon employeur me dit que les deux ne sont pas cumulables et que je dois refuser la proposition de la caisse primaire d’assurance maladie à ce jour plus avantageuse si je prends l’option de la rente.
J’ai un délai de réponse de deux mois de la part de la sécurité sociale afin de contester ou pas Mais je n’arrive pas à avoir une réponse de la caisse primaire d’assurance maladie claire et précise. Car il me parle d’un remboursement à concurrence de 50 % de ou des indemnités en capital précédemment perçu et que cette retenue s’opérera à hauteur de 30 % de mes prochains règlements.
Je suis vraiment dans une impasse pouvez vous m’éclairer ???
Mille merci