Arrêt maladie avant congés maternité

Bonjour,

J'ai été en arrêt maladie au début de ma grossesse pour une durée de 3 mois.
Mon employeur pratiquant la subrogation j'ai perçu mon salaire en intégralité. Par la suite j'ai touché 2 semaines en congés pathologique.
Si jamais je devais être de nouveau en arrêt avant le début de mon congés (le 29 décembre) cet arrêt est il reconnu en simple arrêt maladie et indemnisé par la sécurité social comme t'elle ou existe une prise en charge sans perte de salaire ?

Cordialement.