Congé parental, puis congé maternité et arrêt maladie

Bonjour, malgré la lecture de nombreux topics je ne trouve pas réponse à ma question. Je suis fonctionnaire et en congé parental depuis bientôt un an. Je suis retombée enceinte pendant le congé parental.
Je suis indemnisée à taux plein en congé maternité. J'ai demandé un congé parental à taux partiel ( 50%) à la suite de mon congé maternité. Or, il se trouve que mon médecin m'a prescrit un arrêt maladie en lien avec la grossesse à l'issue de mon congé maternité. Donc cet arrêt intervient le jour même du début du congé parental à temps partiel.
Ma question est la suivante : vais je être indemnisée sur la base de ma situation avant le congé parental ( temps plein) ou bien sur un mi temps ?
Je vous remercie pour l'aide que vous pourriez m'apporter.