Arrêt de travail

Bonjour,
Je suis allé chez le médecin dans l'après-midi en ayant travaillé le matin. Le médecin n'a pas voulu me fournir d'arrêt car toute journée commencée est due par l'employeur. Le problème est que me responsable souhaite que je rende les heures non-travaillées de l'après-midi, ce que je ne veux évidemment pas. Est-ce au médecin de me faire un arrêt ou est-ce mon employeur qui doit considérer que j'ai fait ma journée ?

Bien cordialement.