Arrêt AT par médecin Conseil

Je suis en AT depuis fin août. Lombalgie suite à effort de soulèvement et tendinopathie .je travaille dans le soin à domicile . J'ai tenté une reprise en mi temps thérapeutique d 1 mois qui c'est avéré être un échec.Convoquée par le médecin conseil celui ci me dit qu'il arrête mon AT et me passe en maladie . Car pour lui ça fait trop longtemps que je suis en AT.La médecine du travail ne veux pas me mettre inapte à ce poste.
Je ne me sens pas physiquement car les douleurs sont tjrs là à reprendre mon poste. Hormis démissionner je ne vois pas d'issue.
J'ai effectué des démarches avec une Assistante sociale pour un bilan de compétences.
Est ce que je vais pouvoir le faire avec la décision du médecin conseil. Quelle indemnités vais je percevoir a la suite en maladie.
Je suis complètement perdue.

Merci de m'avoir lue, si qlq peux m'aider à y comprendre qlq chose dans tout ça .
Ah il m'a parlé aussi de maladie professionnelle pour ma tendinopathie. Mais ?