Possibilité de choisir une caisse si 2 emplois dans 2 départements et 2 adresses ?

Dans un département où je vis, je suis autoentrepreneur déclaré à la caisse de sécurité sociale des indépendants mais en parallèle j'ai une mission en qualité d'agent contractuel sur 1 an dans un autre département où j'ai aussi un logement ; je continue mon 1er emploi via visioconférence et par des déplacements vers le 1er département. Mes cotisations sociales sont versées dans le département où je suis inscris ; par contre pour mon emploi sur le second département mes cotisations sociales sont versées sur le département concerné. Si accident ou arrêt de travail, qui verse les indemnités ? Exemple si j'ai un arrêt sur le second département alors que je suis rattaché à ma caisse de sécurité sociale du 1er département, ma caisse me prendra t-elle en charge ?