Carence 3 jours si arret maladie en ESAT (malgré le maintien de salaire prévu pour travailleur Handicapé) ?

Bonjour à toutes et à tous, Je pose cette question concernant un arrêt maladie pour une très proche personne qui en arrêt maladie 3 jours (arrêt par le Docteur le temps d’effectuer le test COVID) et travaillant en ESAT s’est vu décompter de son maigre salaire 3 jours de carence par l’ESAT, sous prétexte que c’était son deuxième arrêt maladie cette année !
R .243-7 du CASF :
• Arrêt maladie La rémunération garantie est maintenue en totalité pendant les périodes ouvrant droit à une indemnisation au titre de l'assurance maladie. Dans ce cas l’ESAT est subrogé dans les droits du travailleur handicapé aux indemnités journalières.
Nous avons cité ce texte de la MDPH : R .243-7 du CASF, confirmant qu’il devait y avoir maintien de salaire dans son intégralité, pour les personnes Handicapées en arrêt maladie, (pendant ou hors période covid. du reste .si nous avons bien compris ?

Voici la réponse du service comptable de l’ESAT :
Puisque l’arrêt est lié au Covid, nous allons lui redonner les 3 jrs de carence. Car clause particulière liée à la pandémie En revanche si l’arrêt avait été un arrêt maladie normal (non lié au COVID) les 3 jours de carence auraient été appliqués
Car depuis la création de l’ESAT les clauses sont bien celles que je vous ai communiqué précédemment.

Question : Les 3 jours de carence (donc retenue sur la rémunération) doivent ils s’appliquer comme défini par le service comptabilité en temps ordinaire, hors épidémie de COVID ?
réponse souhaitée par un expert Ameli