Demission pendant instruction de dossier suite a reserve de l'employeur

Bonjour,
Mon employeur a émis une reserve concernant mon accident de travail auprès de la CPAM. Mon dossier est donc en instruction après avoir rempli leur questionnaire.
Je suis rémunéré comme si j'etais en arrêt de travail et non en accident de travail.
Ma question est la suivante: Puis je poser ma demission pendant l'instruction de mon dossier?
Car dans tous les cas je ne saurais pas en mesure de reprendre mon emploi actuel.
Si oui y a t'il des conséquences?
Je vous remercie d'avance pour vos réponses.
Cordialement,