certificat isolement

en isolement pendant 3 semaines puis une semaine d'arrêt (sous la pression de mon employeur) puis confirmation de l'isolement par la médecine du travail j'ai repris (sous la pression une nouvelle fois de l'employeur) mes missions en présentiel. les missions étant désormais amoindries mon employeur me force à poser des congés ou des rtt. puis je revenir à la situation antérieure avec le certificat d'isolement qui coure jusqu'à nouvelles consignes gouvernementales jusqu'au 10 juillet (fin de l'état d'urgence sanitaire) ?