Congé grave maladie et indemnités journalières

Bonjour je suis salarié de l éducation nationale en droit public non fonctionnaire mais en cdi.j ai une pension d invalidité 1 ère catégorie le conseil médical vient de m accorder un congé grave maladie de 6 mois.
Est ce que mon dr doit faire des arrêt successifs ? Mon employeur l état n applique pas la subrogation donc je toucherai double salaire a rembourser sous retenue mensuelle par mon employeur MAIS ce double salaire ferait que je dépasse mon montant de comparaison donc je préférais ma pension d invalidité.
Donc mon dr est t il.obligé de faire des arrêts et sinon puis je demander à ne pas toucher d indemnités journalières ?
Merci de votre réponse