ALD et jour de carence

Bonjour,
Je suis contractuel de droit public dans la fonction publique territoriale.
J'ai eu un premier arrêt de travail d'un mois dans le cadre d'une ALD, à l'issue de cet arrêt de travail j'ai pris un mois de congés pensant pouvoir reprendre le travail à mon retour de congés. À la date prévue pour reprendre le travail, j'ai eu un une prolongation de mon arrêt de travail toujours dans le cadre d'une ALD.
Mon employeur me retient une journée de carence pour ce 2e arrêt de travail au motif qu'il y a eu une interruption entre le premier arrêt et le 2e arrêt (mes congés) et que rien ne signale que cette prolongation est en lien avec l’ALD initiale.
Or à mon sens s'il y a prolongation et non nouvel arrêt initial je suis bien forcément toujours dans le cadre de l’ALD.
Pouvez vous me confirmer que la journée de carence du 2e arrêt de travail (la prolongation) n'a pas lieu d'être ?
Merci.