Indemnité congés payés suite reconnaissance maladie professionnelle reconnue après démission

Bonjour
J ai constitué un dossier pour une demande de reconnaissance de maladie professionnelle. L'instruction a suivi son cours, j ai été indemnisé en maladie durant cette période. Avant la décision du CRRMP, j ai démissionné et trouvé un autre travail.
Aujourd'hui, je viens d apprendre que mon dossier était reconnu comme étant une maladie professionnelle.
Mes IJ sont revalorisées et versées par la CPAM (pas de subrogation)
Ma question porte sur les congés payés. Étant indemnisé en maladie, mon employeur m a fait signer un solde tout compte lors de ma démission, où je ne cotisais pas pour les CP durant la procédure MP.
Doit il effectuer un nouveau calcul des CP du fait de la reconnaissance de la MP, où me suis je fait avoir en signant mon solde tout compte?
Merci par avance de votre retour