Indémnités journalières et statut de stagiaire rémunéré par la région ?

Bonjour,
Je me trouve confronté à un problème. Je suis stagiaire en formation professionnelle et rémunéré par la région. J'ai signé un contrat avec la région qui stipule qu'au même titre qu'un salarié ordinaire, je cotise pour la sécurité sociale au même taux et que je suis soumis au même IJ : 3 jours de carence + 50%, comme tout le monde, article de loi à l'appui. Seulement voilà j'ai été arrêté les deux dernières semaines de Juillet et je n'ai reçu que 55 euros fin Août. Je vous laisse imaginer ma stupéfaction et la situation dans laquelle je me trouve. Comment se fait il que la région ne soit pas en accord avec la cpam ? Je ne pense pas que la région fasse signer des contrat dans lesquels les informations concernant les IJ des stagiaires rémunérés soient fausses.