Congé pathologique - Fonction publique - Décompte de jours

Bonjour,
Je travaille dans la fonction publique d'état en tant que contractuelle. J'ai eu un enfant et suite à mon congé maternité et notamment mon accouchement difficile j'ai eu un congé pathologique suivi par de la maladie ordinaire. Pour la maladie ordinaire j'ai eu un jour de carence + paiement à 90% au début puis à 50% au bout de 2 mois (et non 90jours).

Ma question : est-ce que le congé pathologique postnatal doit-il rentrer dans le décompte des jours de maladie ordinaire (même s'il est rémunéré comme un congé pathologique et non un congé pour maladie ordinaire) ?

Merci d'avance