Invalidité suite arrêt de travail avec ALD

Bonjour,

Suite arrêt de travail avec ALD, le service médical a décidé du passage en invalidité c2

Nous avons bien compris que les ijss seraient 'remplacées' par une autre indemnisation;
meme si la période limitée à 3 ans d'ijss n'est pas atteinte

En revanche, comme l'état de santé ne permet pas une reprise de travail, concernant le justificatif d'absence pour l'employeur, le médecin de famille doit continuer à faire des arrêts
même s'ils n'y a plus d'ijss?
Sinon comment procéder?

Merci pour votre éclairage