Bulletin de situation pour demi journée d’hospitalisation

Bonjour
Je dois suivre un traitement en hospitalisation de jour toutes les 6 semaines, cela dure la matinée.
L’hôpital me propose de me délivrer des bulletins de situation pour justifier mes absence à mon employeur, avec heure d’entrée et de sortie, soit 9h-12h. Je peux donc travailler l’après midi.
Que dois je faire : travailler l’après midi ou non ?
Je crois comprendre qu’il ne faut pas travailler le jour d’un bulletin de situation pour pouvoir toucher les indemnités journalières, mais du coup comment justifier mon absence du bureau l’après midi puisque mon traitement ne dure que le matin ?
Merci d’avance !!