serai-je à nouveau indemnisé ?

Je suis en arrêt de travail pour maladie depuis le 8 octobre 2019. Mes indemnités journalières sont suspendues depuis le 17 mai suite à une décision du médecin conseil qui estime que mon arrêt n'est plus médicalement justifié. J'ai contesté cette décision et je passe une expertise médicale le 9 septembre. Le 1er juin un médecin autre que celui qui me prescrit mes arrêts habituellement m'a fait une prolongation d'arrêt pour un autre motif que celui pour lequel j'ai été en arrêt jusqu'au 31 mai. Du fait que ce soit un autre médecin qui m'a prolongé pour un motif différent vais-je à nouveau percevoir des indemnités journalières ? J'espère avoir été assez clair et merci pour votre réponse.