Prolongation arrêt maladie, fin CDD et indemnisations

Bonjour,

Je suis en arrêt maladie depuis le 28 août 2019 (grossesse compliquée). Mon gynécologue m'a prolongé l'arrêt de travail, (sans coupure) du 28 septembre au 4 novembre 2019.
Or, mon contrat CDD prend fin en date du 30 septembre 2019.
Je voudrais donc savoir comment cela se passe pour mon indemnisations étant donné que la fin de mon contrat intervient bien avant la fin de l'arrêt de travail et que mon employeur pratiquait jusque là la subrogation ?
Recevrai-je moi-même directement les indemnités journalières à partir de la fin de mon contrat ?
Je vous remercie par avance pour votre réponse.