Qui prend en charge le congé maternité?

Bonjour,
Actuellement contractuelle dans la fonction publique territoriale je vais passer stagiaire au début de mon congé maternité début Avril.
Mes questions étant qui indemnise mon congé maternité?
L'assurance maladie ou la fonction publique territoriale?
Et quelles sont les papiers à fournir et à qui afin de percevoir ces indemnités?
J'aimerai également décaler mon congé prénatal de 3 semaines censé débuter la semaine prochaine et j'ai pour cela envoyé en ligne un certificat médical.Est-ce suffisant ou dois je me rendre sur place dans une agence ?
Merci d'avance pour vos réponses