Arrêt maladie dérogatoire rétroactif pour personne ayant travaillé

Bonjour,

me sentant mal depuis la veille je suis allée faire un test en prévenant mon employeur qui m'a dit de continuer à télétravailler en attendant les résultats du test. Ce que j'ai fait mais mes symptômes se sont aggravés et je ne pouvais plus télétravailler. Mon employeur m'a dit de faire une demande d'arrêt dérogatoire. Pour cet arrêt on demande la date des symptômes j'ai donc répondu à cette question. Du coup mon employeur a décidé de considérer que je n'avais pas travaillé pendant ces 2 jours et m'a mis en arrêt maladie pour 7 jours alors que je n'ai cessé mon activité que 3 jours. Il refuse de changer les choses et me dit qu'il est tenu par les dates du certificat d'isolement.
Est-ce légal?

Vous remerciant par avance