Mi temps thérapeutique et congé maternité

Bonjour,
Je suis fonctionnaire, j'ai eu un accident de travail fin 2018 ,jai était arrêté durant 2 ans et demi.
Je ne suis tjr pas consolidée. Jai repris le travail à mi temps thérapeutique depuis 6 mois à renouvelé une fois.
Je suis actuellement enceinte j'ai dû arrêter mes traitements lié à l'accident de travail car ce n'est pas compatible avec la grossesse. Je vais accoucher dans 5 mois ,Ma question est la suivante : est ce que le médecin doit me mettre en arrêt vu que je ne suis tjr pas consolidée et que mon traitement est suspendu ou juste en congé maternité ?
Et si je suis en congé maternité est ce que mon accident de travail se clôture ? Je suis perdue je ne sais pas quoi faire, sachant que je n'ai toujours pas informé mon employeur de la grossesse car je crains un reclassement professionnel, ce n'est vraiment pas ce que je souhaite.
Merci de bien vouloir me renseigner.
Cordialement