declaration de naissance hors delai?

Bonjour ma fille a declaré sa grossesse en mai 2020 , par papier car son medecin traitant n a pas pu le faire en ligne il y avait un disfonctionnement du service , et la elle a accouché le 08/11/2020, sauf qu'à la maternite ils viennent de nous dire que il n avait aucune trace de cette declaration !
La caf et l employeur eux ont bien enregistrer la grossesse .
Il y a eu 3 arrets maladie entre le 05/08 et le 30/09
Comment regulariser sa situation , quelles seront les consequences car du coup , il n y a pas eu de paiement du conge mat , et elle va devoir payer les frais a l hôpital ...et elle ne peux donc pas declarer en ligne la naissance de son fils !
Merci